复合碳源专门应用于污水处理系统中，以解决碳源不足而导致的出水NOx-N偏高问题，提高污水处理系统的反硝化能力，同时对强化生物除磷也有很好的效果。该产品通常用于缺氧池，反硝化滤池等缺氧区域，也可用于为厌氧反应器或者好氧反应器提供碳源。 复合碳源应用于城市及城镇等市政生活污水微生物处理中及屠宰、本地制革、本地食品、本地电镀等工业废水处理中。目前市场上常用的碳源包括甲醇、本地醋酸、本地乙酸钠、本地面粉、本地葡萄糖、本地生物质碳源、本地污泥水解上清液、本地啤酒废水和垃圾渗滤液等。在应用过程中，需要根据实际工程情况选择合适的碳源。

在污水处理系统中，微生物所需的有机物称为碳源。在活性污泥培养驯化阶段，由于构建的生物池中没有微生物，因此需要对微生物进行培养、收集和驯化。这一阶段微生物需要大量的碳源保持快速增长。现阶段，普通城市生活污水中的有机污染物作为碳源还不能满足微生物的生长需求。同时，由于生活污水中的碳源是一种复杂的有机物，往往不能被初生长的微生物吸收利用。因此，在这个阶段，补充碳源是很有必要的。在一些情况下，污水的碳氮比失衡，特别是在收集面积小、收集人口少，或在工业废水厂，污水的碳氮比失衡。因此，在这样的进水环境之中，需要为微生物补充碳源，以维持微生物的高活性。碳源在污水处理厂的使用主要分为提供微生物合成菌体繁殖的主要营养、附近反硝化的电子供体、生物除磷协助聚磷菌释放。也可以说碳源就是污水厂维持微生物生长较主要的原料之一。